Главная / Молекулярная онкология / Вирусный онкогенез и его молекулярные основы / Геном компетентных по репликации ретровирусов

Геном компетентных по репликации ретровирусов

18.01.2011г.

Геном компетентных по репликации ретровирусов состоит из следующих идентифицированных областей:

  • R—короткая последовательность (20—80 нуклеотидов), по-вторяющаяся на обоих концах вирусной РНК. Она используется в процессе репликации, обеспечивая перенос вновь синтезированной цепи (фрагмента) ДНК и ДНК-полимеразы с 5-конца на З-конец генома [Coffin J., 1980; Boone L., Skalka A., 1981]; U5 — определяемая как область (80—100 нуклеотидов) уникальных последовательностей, отделяющая R от сайта связывания затравки (primer-binding—РВ);
  • РВ(—) —сайт связывания тРНК-затравки для синтеза негативной цепи ДНК. Он комплементарен 16—19 нуклеотидам участка затравки З-терминатора [Coffin J., 1980];
  • L — нетранслируемые последовательности (около 250 нуклеотидов в случае вируса саркомы Рауса — ВСР), предшествующие кодирующей области для вирусных белков. Они содержат последовательности, необходимые для упаковки геномной РНК в вирионы. R, U5, РВ(—), большинство или все L являются частью лидирующих последовательностей, которые лигируются с субгеномными РНК при помощи сплайсинга (например, с иРНК env и src) [Coffin J., 1980; Dhar R. et al., 1980; Weiss S. et al., 1981]; gag— область (около 2 т. с), кодирующая внутренние структурные белки вириона. В результате трансляции этих последовательностей образуется высокомолекулярный полипротеин-предшественник (precursor polypeptide — Pr), который затем подвергается «нарезанию», образуя зрелые белки [Eisenman R., Vogt V., 1978];
  • pol — область (около 3 т. о.), кодирующая вирусную РНК-зависимую ДНК-полимеразу с ее различными энзиматическими активностями. Трансляция, по-видимому, осуществляется одновременно с обоих генов — gag и pol, в результате чего синтезируется предшественник с молекулярной массой 180—200 кило-дальтон (кд), впоследствии подвергающийся процессированию, образуя один или два полипептида [Gerard G., Grandgenett D., 1980; Coffin J., 1982];
  • env — область (около 2 т. о.), кодирующая белки, находящиеся на поверхности вирусной оболочки. По крайней мере один из них гликолизирован. Транслируются эти белки на матрице иРНК, прошедшей сплайсинг. Предшественник, синтезированный на этой иРНК, также подвергается процессингу в два зрелых белка [Klementz R., Diggelmann H., 1978];
  • src-Последовательность найдена только в ВСР. Эта область (2,2 т. о.) ответственна за быструю трансформацию инфицированных фибробластов in vitro и не требуется ретровирусу для репликации. На субгеномной, подвергнутой сплайсингу иРНК синтезируется фосфопротеин (phosphopolypeptide — рр) с молекулярной массой 60 кд, имеющий протеинкиназную активность. Мутанты, которые утрачивают src-функцию и большую часть гена, но не весь ген, с высокой частотой возникают в процессе пассирования вируса на клетках. Эти вирусы получили название дефектных по трансформации (td-мутанты);
  • РВ(+) —участок идентифицирован на 5-конце и 3-области, содержит сайт начала синтеза позитивной цепи вирусной ДНК, хотя затравка для этой реакции неизвестна. Эта область богата пуринами и содержит высококонсервативные последовательности, гомологичные у неродственных ретровирусов [Coffin J., 1982];
  • U3 — область располагается между PB(-f-) и R недалеко от З-конца генома и представлена дважды в интегрированном и неинтегрированном провирусе. Она варьирует в размере от 0,2 до 1,0 т. о. у различных вирусов. Одна копия U3 располагается к 5-концу сайта инициации транскрипции и содержит промотер транскрипции [Yamamoto H. et al., 1980];
  • U5R — иногда называется как «strong-stop-область»;
  • LTR — длинный концевой повтор, представляет собой комбинацию последовательностей U3RU5 геномной РНК в линейной и кольцевой формах ДНК провируса.


«Молекулярная онкология»,
И.Ф. Сейц, П.Г. Князев



Смотрите также: